John Connor er manden, der er bestemt til at lede den menneskelige modstandsbevægelse mod Skynet og dets hær af Terminators. Men fremtiden, som Connor blev opdraget til at tro på, ændres delvist af Marcus Wrights tilsynekomst, en fremmed hvis sidste erindring er at være på dødsgangen. Connor må beslutte, om Marcus er sendt fra fremtiden, eller reddet fra fortiden. Mens Skynet forbereder sit endelige angreb, begiver Connor og Marcus sig begge ud på en odyssé, der fører dem ind i centrum af Skynets operationer, hvor de afdækker den frygtelige hemmelighed bag den mulige udryddelse af menneskeheden.