Et skrøbelig fred Kapitel 3 af 5 Jedi-ridderne, engang beskyttere af Republikken, er blevet ødelagt af deres gamle fjender - Sith'erne. Nu har den nye imperiale regime udpeget nådesløse inquisitorer til at jage enhver potentiel overlevende Jedi. Tidligere har et Jedi-hold - den hovedstivnede Cere Junda og hendes mester Eno Cordova - rejst til planeten Ontotho for at løse en tvist mellem Daa Corporation og de lokale Fylari. Daa ønsker at udforske og udnytte et mystisk tempel i Fylar, en indsats som lokalbefolkningen er stærkt imod. Cere har allieret sig med Fylari, i troen på at Dylanto-formand Daa indyndte Fylari for et voldeligt angreb, der tog livet af hendes mester. Cere's forsøg på at konfrontere Daa foran Ontothon-regeringen endte i konflikt, og hun snævert undslap med livet, klar til at kæmpe for Fylari! Mens vi er i nutiden - i imperiets tidsalder - jager en ondskabsfuld inquisitor efter spor ved ruinerne af Fylar...