Nach den französischen Atomtests im Südpazifik wird eine unbekannte Kreatur beobachtet, die ostwärts durch den Panama-Kanal zieht. Der Wissenschaftler Niko Tatopolous wird hinzugezogen, um dem Vorfall nachzugehen, und er kommt rasch zu dem Schluss, dass durch die Explosionen ein riesiges, radioaktiv verseuchtes Echsenwesen geschaffen wurde. Godzilla macht sich dann nach Norden auf den Weg, landet in Manhattan und beginnt, in der Großstadt Verwüstung anzurichten. Selbst mit der vereinten Kraft des US-Militärs im Kampf gegen das Monster, wird es ausreichen, um die Menschen von New York zu retten?