Im bunten und warmen Tropenmeer des Great Barrier Reefs lebt ein Clownfisch namens Marlin sicher und abgeschieden in einer ruhigen Sackgasse mit seinem einzigen Sohn Nemo. Aus Angst vor dem Ozean und seinen unberechenbaren Risiken kämpft er darum, seinen Sohn zu beschützen. Nemo, wie alle Jungfische, ist neugierig darauf, das mysteriöse Riff zu erkunden. Als Nemo unerwartet weit von zu Hause entfernt und in ein Aquarium in einer Zahnarztpraxis versetzt wird, findet sich Marlin als unwahrscheinlicher Held auf einer epischen Reise wieder, um seinen Sohn zu retten. Auf seinem Weg wird Marlin von einer guten Samariterin namens Dory begleitet, einem Regal Blue Tang-Fisch mit dem schlechtesten Kurzzeitgedächtnis und dem größten Herz der gesamten Ozeane. Während die beiden Fische weiter auf ihrer Reise voranschreiten und zahlreichen Gefahren begegnen, zwingt Dorys Optimismus Marlin immer wieder, den Mut zu finden, Risiken einzugehen und seine Ängste zu überwinden. Dadurch erlangt Marlin die Fähigkeit zu vertrauen und zu glauben, wie Dory, dass am Ende alles gut wird. Gegen Seefedern, Abwassersysteme und sogar den Menschen selbst führt die schicksalhafte Trennung von Vater und Sohn zum Triumph. Und der einst ängstliche Marlin wird im Auge seines Sohnes und des gesamten Ozeans zu einem wahren Helden.