Aliens from Planet X machen den Menschen der Erde ein unwiderstehliches Angebot: Sie dürfen Godzilla und Rodan ausleihen, um King Ghidorah zu besiegen, und im Gegenzug versprechen sie eine Heilung aller bekannten menschlichen Krankheiten. Doch bald wird die Doppelmütigkeit der Aliens offenkundig, da sie alle drei Monster in ihrem Bestreben einsetzen, die Erde zu erobern.