Sata vuotta, kaksi robotti-rotua avaruusolioita – Autobottit ja Decepticonit – ovat käyneet sotaa, ja universumin kohtalona on pelissä. Kun taistelu saapuu Maahan, kaiken—pahan Decepticonien ja lopullisen vallan—välissä on vain vihje, joka on nuoren Sam Witwickyn käsiin. Tavanomaisena teinipoikana Sam on uppoutuneena koulun, ystävien, autojen ja tyttöjen arjen huoliin. Eivätkä hänen tietämyksensä mukaan hänellä ole aavistustakaan, että hän yksin on ihmiskunnan viimeinen mahdollisuus selviytyä, kun Sam ja hänen ystävänsä Mikaela löytävät itsensä Autobottien ja Decepticonien välisessä kiristyksessä. Maailma vaakalaudalla ollessaan Sam alkaa ymmärtää Witwicky-kodin todellisen tarkoituksen – "Ilman uhrauksia ei ole voittoa!"