Spockin viimeisen uhrautumisen jälkeen U.S.S. Enterprise -miehistö palaa Maahan uudelleen muodostuneelta Genesis-planeetalta. Saavuttuaan he saavat tietää, että kotiin paluu ei ole helpompaa: Scotty saa uuden tehtävän, Dr. McCoy vaikuttaa menettävän järkensä ja Enterprise aiotaan lakkauttaa. Vasta kun Kirk kohtaa Spockin isän, hän saa tietää vanha ystävänsä saattavan saada toisen mahdollisuuden elämään, jos miehistö selviää Klingonhyökkäyksestä ja palaa Genesis-planeetalle.