Dopo i test atomici francesi nella parte sud del Pacifico, una creatura sconosciuta viene avvistata mentre si dirige verso est attraverso il Canale di Panama. Lo scienziato Niko Tatopolous viene chiamato per indagare sulla faccenda e arriva rapidamente alla conclusione che una gigantesca lucertola irradiata sia stata creata dalle esplosioni. Godzilla si dirige poi verso nord, atterrando a Manhattan per iniziare a seminare il caos nella grande città. Anche con le forze combinate dell’esercito degli Stati Uniti per combattere il mostro, basteranno a salvare la gente di New York?