Nelle acque tropicali colorate e calorose della Grande Barriera Corallina, un Clownfish di nome Marlin vive al sicuro e appartato in una quieta cul-de-sac con suo figlio unico, Nemo. Paura dell'oceano e dei suoi rischi imprevedibili, lotta per proteggere suo figlio. Nemo, come tutti i pesci giovani, è desideroso di esplorare il misterioso reef. Quando Nemo viene improvvisamente allontanato da casa e catapultato in una vasca da pesci di uno studio dentistico, Marlin si ritrova l'eroe improbabile in un viaggio epico per salvare suo figlio. Nella sua missione, Marlin è accompagnato da un buon samaritano di nome Dory, un pesce blue tang Regal Blue con la peggiore memoria a breve termine e il cuore più grande dell'intero oceano. Man mano che i due pesci proseguono il viaggio, incontrando numerosi pericoli, l'ottimismo di Dory costringe costantemente Marlin a trovare il coraggio per correre rischi e superare le sue paure. Così facendo, Marlin acquista la capacità di fidarsi e credere, come Dory, che le cose andranno a buon fine. Affrontando uccelli marini, sistemi fognari e persino l'uomo stesso, la separazione fatale tra padre e figlio si conclude con trionfo. E il marlin inizialmente pauroso diventa un vero eroe agli occhi di suo figlio e dell'intero oceano.