Sequel al spin-off premiato agli Academy nel 2009 della classica serie di avventura sci‑fi degli anni Sessanta. Il Capitano Kirk e l'equipaggio dell'U.S.S. Enterprise sono richiamati sulla Terra dopo che una forza devastante proveniente dall'interno della loro organizzazione ha lasciato il pianeta nel caos e Starfleet in pezzi. Determinato a chiudere i conti, Kirk parte in una caccia all'uomo con il resto dell'equipaggio, tra cui Spock, Scotty e Chekov, per trovare la parte responsabile prima che il loro intero mondo venga messo in rovina.