Det är en lugn dag i Japan när en märklig vattenfontän sprutar upp i bukten och orsakar panik bland regeringstjänstemännen. Till en början misstänker de endast vulkanisk aktivitet, men en ung företagsledare vågar ana att det kan vara något annat… något levande. Hans värsta mardröm blir verklighet när ett massivt, gälligt monster dyker upp ur djupet och börjar riva igenom staden, och lämnar inget annat än förstörelse i dess spår. När regeringen skyndar för att rädda medborgarna bryter ett brokigt team av volontärer igenom ett nät av byråkrati för att avslöja monsterets svaghet och dess mystiska band till en utländsk supermakt. Men tiden är inte på deras sida – den största katastrofen som någonsin drabbat världen är på väg att utvecklas framför deras ögon.