John Connor är mannen som är förutbestämd att leda människors motstånd mot Skynet och dess armé av Terminators. Men framtiden som Connor vuxit upp att tro på förändras delvis genom Marcus Wrights ankomst, en främling vars sista minne är av att vara på dödsstraff. Connor måste avgöra om Marcus har skickats från framtiden eller räddats från det förflutna. När Skynet förbereder sitt sista anfall ger sig både Connor och Marcus ut på en odyssé som tar dem in i Skynets centrum, där de avslöjar den fruktansvärda hemligheten bakom människosläktets möjliga utplåning.