Godzilla Vs. Destroyah Godzilla, dont le corps est en feu, assiège Hong Kong. On découvre que le Roi des Monstres est sur le point d’un effondrement. Si Godzilla atteint une température critique, une détonation qui en résultera percerait droit jusqu’au noyau de la Terre et aurait des conséquences cataclysmiques. Pendant ce temps, une race mystérieuse d’êtres crustacés est repérée à travers le Japon. Des études récentes ont été effectuées sur un procédé appelé Micro Oxygen, une méthode pour augmenter la taille de quelque chose comme solution possible pour aider à la pénurie alimentaire. Cependant, cette nouvelle créature semble avoir une histoire plus ancienne, née de l’Oxygen Destroyer lui-même qui a tué le Godzilla original en 1954. Godzilla vs. Megaguirus: En 1954, Godzilla apparaît pour la première fois et attaque Tokyo, engulfant la ville de flammes. Le Japon se reconstruit, mais en 1966 Godzilla se réveille après l’établissement d’une centrale nucléaire. La créature attaque Tokai, détruisant l’usine. Le pays cherche alors à éviter l’énergie nucléaire, mais se retrouve incapable d’alimenter la nation. En 1996, une découverte révolutionnaire est faite grâce à une nouvelle source d’énergie: l’énergie plasma. Malheureusement, celle-ci réveille aussi le Roi des Monstres, qui attaque Osaka et le bâtiment qui abrite la technologie. Comme dommages collatéraux, le commanding officer de Kiriko Tsujimori est tué, provoquant une vendetta entre elle et Godzilla. Cinq ans plus tard, les G-Graspers, un groupe destiné à s’occuper de Godzilla, commencent à tester une nouvelle arme: la Dimension Tide qui crée des mini-trou noir. Ils espèrent que cela tuera enfin Godzilla. Cependant, le test réveille un mal ancien différent…