Se déroulant au Japon dans les années 1870, The Last Samurai raconte l’histoire du capitaine Nathan Algren, un officier militaire américain respecté engagé par l’Empereur du Japon pour former la première armée du pays à l’art de la guerre moderne. Alors que l’Empereur tente d’éradiquer les anciens guerriers impériaux samouraïs en prévision de politiques gouvernementales plus occidentalisées et propices au commerce, Algren se retrouve étonnamment impressionné et influencé par ses rencontres avec les Samouraïs, ce qui le place au cœur d’un affrontement entre deux époques et deux mondes, guidé par son seul sens de l’honneur.