Nacido en las llamas del infierno y traído a la Tierra como un bebé para perpetrar el mal, Hellboy fue rescatado de fuerzas siniestras por el benevolente Dr. Broom, quien lo crió para ser un héroe. En la secretaría Bureau of Paranormal Research and Defense del Dr. Broom, Hellboy forma una familia poco probable que consta del telepático "Mer-Man" Abe Sapien y Liz Sherman, la mujer a quien ama y que puede controlar el fuego. Escondidos de la misma sociedad que protegen, se alzan como la línea clave de defensa contra un malvado loco que busca reclamar a Hellboy para el lado oscuro y usar sus poderes para destruir a la humanidad.