Dr. Jo Harding (Helen Hunt) houdt niet veel van tornado’s. Als jonge meisje zag ze haar vader verloren gaan in een F5-tornado, de sterkste en dodeligste categorie die er bestaat. Ze heeft haar leven gewijd aan de studie van de dodelijke trechterwinden en is vastbesloten een revolutionair tornado-analytisch systeem te testen, bedoeld om de kennis van de mens over hoe stormen werken aanzienlijk te verbeteren en hopelijk levens te redden door zowel bewustwording als de tijd voor early warning te vergroten voordat ramp toeslaat. Haar bijna ex-man, Bill (Bill Paxton), dient haar kopieën van hun scheidingspapieren te overhandigen, papieren waarvan zij schijnt terughoudend te zijn ze te tekenen. Midden in hun gesprek (met Bill’s nieuwe verloofde op sleeptouw) slaat een storm toe, en Bill en Jo keert meteen terug naar de modus van stormjagers, in de hoop met succes het bovengenoemde nieuw-fangende apparaat, gedoopte "Dorothy", aan de wind te ontsluiten. Een nacht van mislukte pogingen, dodelijke stormen, gevaarlijke situaties en een ongecoöperatieve en gemene rivaliserende groep stormjagers kan Bill en Jo wellicht helpen te herinneren wat ze het meest liefhebben, precies te midden van enkele van de meest helsachtige storms die Oklahoma ooit heeft gezien.