Een Rat genaamd Remy droomt ervan een grote Franse chef-kok te worden, ondanks de wensen van zijn familie en het duidelijke probleem van een rat te zijn in een bedrijf dat ronduit fobie heeft tegen knaagdieren. Wanneer het noodlot Remy in de tunnels van Parijs plaatst, bevindt hij zich ideaalgelegen onder een restaurant dat beroemd is geworden door zijn culinaire held, Auguste Gusteau. Ondanks de schijnbare gevaren van een onwaarschijnlijk — en zeker ongewenst — bezoeker in de keuken van een fijn Frans restaurant, zet Remy's passie voor koken al snel een hilaren en opwindende rattenrace in gang die de culinaire wereld van Parijs op zijn kop zet. Remy bevindt zich in de knel tussen zijn roeping en passie in het leven of terugkeren voor altijd naar zijn vorige bestaan als rat. Hij leert de waarheid over vriendschap, familie en het feit dat hij geen keuze heeft dan te zijn wie hij echt is, een rat die chef-kok wil zijn.