John Connor er mannen som er bestemt til å lede menneskehetsens motstandsbevegelse mot Skynet og dets hær av Terminators. Men fremtiden Connor ble oppfostret til å tro på, endres delvis av ankomsten til Marcus Wright, en fremmed hvis siste minne er at han satt på dødsdom. Connor må avgjøre om Marcus har blitt sendt fra fremtiden, eller reddet fra fortiden. Når Skynet forbereder sitt endelige angrep, legger både Connor og Marcus ut på en odyssé som tar dem inn i hjertet av Skynets operasjoner, hvor de avdekker den fryktelige hemmeligheten bak den mulige utslettelsen av menneskeheten.