Når et punktert dekk frakter Bonnie (Emily Hahn) og hennes mor (Lori Alan) til et lite veikors motel for natten, begynner Woody (Tom Hanks), Buzz (Tim Allen), Jessie (Joan Cusack), Mr. Potato Head (Don Rickles), Rex (Wallace Shawn), Mr. Pricklepants (Timothy Dalton) og Trixie (Kristen Schaal) å forsvinne en etter en; ofre for et ondsinnet, ulevd vesen som slår ned fra skyggene. Snart har alle blitt tatt bort unntatt Jessie, som møter Combat Carl (Carl Weathers), en skadet soldat og overlevende som har vært vitne til sin andel blodige skrekkhistorier siden han ble separert fra eieren Billy. Snart finner imidlertid Jessie og Carl seg fanget også, fanger av eBid-selger Ron the Motel Manager (Stephen Tobolowsky) og hans lojale kjæledyr- iguana, Mr. Jones (Dee Bradley Baker). Med litt mot, kunnskap og litt hjelp fra noen nye venner -- Transformerende japanske robot Transitron (Peter Sohn) og papirklipp-åndende Pocketeer (Ken Marino) blant dem -- ender det opp med at Jessie må overvinne sin dypeste frykt og redde dagen. Erm... natt. Av Terror!