W kolorowych i ciepłych tropikalnych wodach Wielkiej Rafa Koralowej mieszka Błazenek o imieniu Marlin, który żyje bezpiecznie i w ciszy w spokojnym zaułku ze swoim jedynym synem, Nemo. Lękliwy przed oceanem i jego nieprzewidywalnymi ryzykami, usiłuje chronić swojego syna. Nemo, jak wszystkie młode ryby, pragnie odkrywać tajemniczą rafę. Kiedy Nemo niespodziewanie zostaje zabrany daleko od domu i wrzucony do akwarium w gabinecie dentystycznym, Marlin staje się nieprawdopodobnym bohaterem w epickiej podróży, by uratować syna. W swojej wyprawie Marlinowi towarzyszy dobry Samarytanin o imieniu Dory, ryba Regal Blue Tang z najgorszą pamięcią krótkotrwałą i największym sercem w całym oceanie. Jak dwie ryby kontynuują podróż, napotykając liczne niebezpieczeństwa, optymizm Dory wciąż zmusza Marlina do odnalezienia odwagi, by podejmować ryzyko i przezwyciężać lęki. Dzięki temu Marlin zyskuje zdolność do zaufania i wiary, że sprawy ułożą się w końcu tak, jak trzeba, podobnie jak Dory. Konfrontując się z ptakami morskimi, systemami kanalizacyjnymi, a nawet samym człowiekiem, ojca i syna niefortunna separacja kończy się triumfem. A kiedyś lękliwy Marlin staje się prawdziwym bohaterem w oczach swojego syna i całego oceanu.