Godzilla: Tokyo S.O.S: W 2004 roku Kiryu przechodzi modyfikacje naprawcze po bitwie z Godzillą rok wcześniej. Premier Hayato Igarashi akceptuje wybór Głównego Naukowca Yoshito Chujō, aby zastąpić Dzwon Absolutu Zera potężnym Tri-Maserem. Shobijin (bliźniaczki Mothry) ostrzegają rząd japoński, że Godzilla powraca do Japonii, ponieważ użyli w projekcie Kiryu kości oryginalnego Godzilli. Jeśli zwrócą kości na dno morza, Mothra chętnie zajmie miejsce Kiryu w obronie Japonii, ale jeśli ich nie zwrócą, Mothra wypowie wojnę ludzkości. Szybko pojawia się Kamoebas, gigantyczna żółwia mata mata, znaleziona wyrzucona na brzeg japońskiej plaży. Na podstawie ran na szyi Kamoebas stwierdzono, że zabiła go Godzilla. Godzilla i Mothra walczą, ale Godzilla wydaje się mieć przewagę. Naprawy zakończone na czas, Kiryu udaje się wyrównać szanse, lecz Godzilla wciąż wyrzuca go i Mothrę. W międzyczasie na Infant Island dwie larwy bliźniaczek Mothry wykluwają się z jaja Mothry i rzucają się, by pomóc matce. Gdy Kiryu przechodzi ponowne naprawy, larwy próbują powstrzymać Godzillę, ale Mothra poświęca się, latając na drodze godżliowego oddechu atomowego, ratując larwy. W samą porę Yoshito i ludzie naprawiają Kiryu, która przebija klatkę Godzilli świdrem, co powoduje krwawienie i ryk bólu. Larwy zaczynają łączyć Godzillę w suknie. Właśnie wtedy, pilot Kiryu, Azusa Kisaragi, otrzymuje rozkaz od Igarashi, by zniszczyć Godzillę, zanim projekt Kiryu zostanie porzucony; dusza Kiryu ponownie się budzi poprzez ryk Godzilli. Cybernetyczny mechanizm podnosi Godzillę i utrzymuje jego chwyt za pomocą lin. Kiryu używa następnie swoich dopalaczy, aby unieść siebie i Godzillę na dno oceanu. W scenie po końcowej części filmu, w nieujawnionej lokalizacji, przedstawione jest laboratorium wypełnione pojemnikami zawierającymi DNA licznych kaijów Toho. W japońskiej wersji narrator ogłasza, że eksperyment „bio-formacja” z udziałem „wygasłego podmiotu” ma się odbyć, sugerując, że JXSDF planuje stworzyć kolejny mecha lub kaiju‑bazy superbroń, co mogłoby oznaczać ponowne pojawienie się Godzilli lub innego potwora. W japońskiej wersji Godzilla i Kiryu widziani są jeszcze raz, ryczący, gdy zstępują w ocean. Godzilla Final Wars: Lata po pierwotnym ataku na Tokio w 1954 roku Godzilla jest uwięziony pod lodem w Antarktyce po bitwie z oryginalnym Gotengo. W kolejnych latach katastrofy środowiskowe wywołują pojawienie się gigantycznych potworów i superludzkich, zwanych „mutantami”, którzy następnie zostają zrekrutowani do Earth Defense Force (EDF), by walczyć z potworami. Ulepszony Gotengo, dowodzony przez kapitana Gordona, walczy i niszczy Manda, ale statek zostaje uszkodzony w trakcie bitwy, a jego kapitan Douglas Gordon zawieszony jest w EDF. Mutantowy żołnierz Shinichi Ozaki zostaje zadany do ochrony uniwersalnego biologa, dr Miyuki Otonashi, wysłanej na badanie mumifikowanego potwora. Zostają przetransportowani na Infant Island, gdzie napotykają Shobijin, wróżki Mothry, które ujawniają mumifikowanego potwora jako Gigan, obcego cyborga wysłanego, by zniszczyć Ziemię i którego ostatecznie pokonała Mothra. Ostrzegają, że bitwa dobra ze złem nadejdzie wkrótce i Ozaki musi wybrać stronę. Ogromne potwory zaczynają atakować kilka największych miast. EDF angażuje stworzenia, które znikają w tajemniczych okolicznościach w momencie pojawienia się nad Tokio kosmicznej matki-okołlodu. Obcy, nazwani Xiliens, ostrzegają, że nadciągająca planeta zwana „Gorath” wkrótce uderzy Ziemię. Pokój zostaje podpisany między Ziemią a Xiliens. Tymczasem Minilla, syn Godzilli, zostaje odnaleziony w lesie przez chłopca i jego dziadka. Nieufny wobec Xiliens, Ozaki, Miyuki i jej siostra Anna odkrywają, że Gorath, który widzieli, to tak naprawdę hologram i że kosmici zastąpili kilku członków EDF duplikatami. Po ujawnieniu swojego rodzaju, zabijając swojego przełożonego, aby objąć przywództwo, kontroler X ujawnia ich plany wykorzystania ludzi jako źródła pożywienia i jednoczesnego przejęcia kontroli nad wszystkimi mutantami, z wyjątkiem Ozaki. X ma również potwory pod swoją kontrolą i budzi Gigana, aby zmusić ich do wyeliminowania EDF. Grupa ucieka, z Giganem depczących ich śladem; Gordon przekonuje ich, by podróżowali na Antarktydę, aby uwolnić Godzillę, która łatwo niszczy Giana. Gotengo prowadzi Godzillę do bitwy z innymi potworami i wraca do Tokio, by zaangażować się z Xiliens. Po przeniknięciu do matkikosmosu, grupa zostaje schwytana i przyprowadzona przed X, gdy ten przywołał Gorath na Ziemię. Choć Godzilla niszczy Gorath tuż przed jego upadkiem, ten uwalnia Monster X i obie potwory toczą walkę. Zaktualizowany Gigan pomaga Monster X, lecz zostaje przechwycony przez Mothrę, która ciężko zostaje ranna, jednocześnie udaremniając cybernetycznego potwora. W statku Xilien, gdy rozegruje się walka i nie może on przejąć kontroli nad człowiekiem z powodu błogosławieństwa Shobijinów, X wyjawia, że zarówno on, jak i Ozaki są „Keizerami”. X zostaje śmiertelnie ranny, lecz uruchamia samodestrukcję statku, gdy grupa cofa się do Gotengo tuż przed wybuchem matkikosmosu. Godzilla i Monster X kontynuują walkę, gdy ten drugi przemienia się w swoją prawdziwą formę, Keizer Ghidorah. Na początku Keizer Ghidorah ma przewagę, ale Godzilla ostatecznie wychodzi zwycięsko na końcu. Minilla pojawia się na miejscu i przekonuje Godzillę, by nie zniszczył Gotengo. Ocalałe osoby obserwują, jak Godzilla i Minilla wracają do oceanu.