Godzilla Vs. Destroyah Godzilla, com o corpo em chamas, lança um cerco a Hong Kong. Descobre-se que o King of the Monsters está à beira de um colapso. Se Godzilla atingir uma temperatura crítica, uma detonação resultante irá romper diretamente até o núcleo da Terra e terá um resultado catastrófico. Enquanto isso, uma misteriosa raça de seres semelhantes a crustáceos é avistada por todo o Japão. Estudos recentes foram feitos sobre um processo chamado Micro Oxygen, um método de aumentar o tamanho de algo como possível solução para ajudar com a escassez de alimentos. Contudo, essa nova criatura parece ter uma história mais antiga, nascida justamente do Oxygen Destroyer que matou o Godzilla original em 1954. Godzilla vs. Megaguirus: Em 1954, Godzilla aparece pela primeira vez e ataca Tóquio, envolvendo a cidade em chamas. O Japão se reergue, mas em 1966 reacende Godzilla após estabelecer uma usina nuclear. A criatura ataca Tokai, destruindo a usina. O país então busca evitar energia nuclear, mas se vê incapaz de sustentar a nação. Em 1996, uma descoberta revolucionária é feita a partir de uma nova fonte de energia: energia plasma. Infelizmente, isso também desperta o King of the Monsters, que ataca Osaka e o prédio que abriga a tecnologia. Como dano colateral, o oficial superior de Kiriko Tsujimori é morto, causando uma vendetta entre ela e Godzilla. Cinco anos depois, os G-Graspers, um grupo criado para lidar com Godzilla, começam a testar uma nova arma: a Dimension Tide, que cria minúsculos buracos negros. Espera-se que isso finalmente mate Godzilla. No entanto, o teste desperta um mal antigo diferente...