Nascido nas chamas do inferno e trazido à Terra ainda bebê para perpetrar o mal, o Hellboy foi resgatado por forças sinistras pelo benevolente Dr. Broom, que o criou para ser um herói. No secret Bureau of Paranormal Research and Defense do Dr. Broom, o Hellboy forma uma família improvável, composta pelo telepático "Mer-Man" Abe Sapien e por Liz Sherman, a mulher que ele ama e que pode controlar o fogo. Escondidos da própria sociedade que protegem, eles são a linha de defesa essencial contra um madman do mal que busca trazer o Hellboy de volta para o lado sombrio e usar seus poderes para destruir a humanidade.