Mowgli (Neel Sethi) es un niño huérfano que ha sido criado por lobos en lo profundo de la selva. Habla, al igual que su familia, incluido su madre sustituta Raksha (con voz de Lupita Nyong'o), el líder de la manada Akela (con voz de Giancarlo Esposito) y su amigo Grey (con voz de Brighton Rose), un joven cachorro lobo. Es bienvenido en la selva y entre los otros animales, siempre y cuando él, más o menos, se comporte como uno y no use sus “habilidades humanas” para mejorar su vida o alterar el mundo natural y el orden animal que le rodea. Las cosas cambian cuando un tigre llamado Shere Khan (con voz de Idris Elba), cuyo historial personal con el hombre lo ha dejado quemado y ciego de un ojo, declara su intención de evitar que Mowgli crezca y se convierta en un hombre peligroso. Khan se contendrá siempre y cuando un pacto de paz entre los animales, hecho durante una sequía desafiante, se mantenga; pero cuando lleguen las lluvias, Khan vendrá por su presa. Cuando esas lluvias torrenciales sí llegan, Mowgli decide abandonar la selva para vivir entre su propia especie en lugar de poner en peligro todo, y a todos, a quienes quiere. Con la ayuda de quien lo encontró de niño, un chacal bondadoso, sabio y experimentado llamado Bagheera (con voz de Ben Kingsley), Mowgli se embarca en un peligroso viaje hacia el nuevo hogar que le espera.