Loki (Tom Hiddleston) börtönben van Midgardon elkövetett bűnökért, és a kilenc birodalom békéje és rendje helyreállt; Thor (Chris Hemsworth) diadalmasan tér vissza Asgardiába. Atyja, Odin (Anthony Hopkins), fiában méltó utódot lát; anyja, Frigga (Rene Russo), egy olyan fiút lát, aki végre férfi lett; és társai — Lady Sif (Jamie Alexander), Volstagg (Ray Stevenson), Fandral (Zachary Levi) és Hogun (Tadanobu Asano) — egy nemes harcos, fáradhatatlan barát és tiszteletreméltó fejedelem. De a béke ismét veszélybe kerül, amikor Dr. Jane Foster (Natalie Portman) egy gonosz energiavámpírnak nevezett Aether által megszállottá válik, egy kíméletlen Sötét Elf, Malekith (Christopher Eccleston) mélyűr-hibernációból felkelt, megtámadja az Asgardi fővárost, és csak halált és szívfájdalmat hagy maga után. Döntve, hogy megmenti Jane-t az Aethertől és mindekidő alatt megállítsa Malekithet, Thor felkéri Sifet, a Háborús Három tagjait és Heimdallt, a Bifrost őrét (Idris Elba), toborozza és kiszabadítja megbélyegzett testvérét, Lokit, majd üldözésbe kezd. Másutt, a Földön, Dr. Erik Selvig (Stellan Skarsgård) és veszekedős gyakornoka, Darcy (Kat Dennings) kezdenek szokatlan jelenségekben egyre feltűnőbb növekedést észlelni, amikor közelednek egy eseményhez, amelyet Konvergenciának neveznek; a kilenc birodalom egy centenáriumi összhangja, amelyet Malekith ki akar használni minden létező megsemmisítésére.