Het dragen van de kroon is niet voor iedereen weggelegd — vooral niet als je een nors oger bent die ruikt naar de ondiepe kant van een moeras. Toen Shrek met Fiona trouwde, was het laatste wat hij wilde Far Far Away regeren, maar toen zijn schoonvader, King Harold, plotseling stierf, werd Shrek snel naar de kroon gehesen. Nu, tenzij de terughoudende toekomstige koning een geschikte vervanger kan vinden, zal hij voor de rest van zijn dagen royalerlijk in de penarie zitten. Alsof Shrek al niet genoeg op zijn bord had, heeft Prinses Fiona nog een verrassing in verwachting. Gechoqueerd door de verantwoordelijkheden van het runnen van een koninkrijk en het vaderschap dat voor de deur klopt, gaat Shrek op zoek naar de enige andere mogelijke erfgenaam voor de troon, Fiona's lang verloren neef Artie, een middeleeuwse middelbare-schooluitzondering. Terwijl de oger afwezig is, laat zijn oude aartsvijand Prins Charming zijn knappe hoofd zien en keert terug naar het koninkrijk Far Far Away met vergeving in zijn oppervlakkige kleine hersenpan. Zelfs met Donkey en de altijd zo charmante Puss In Boots aan hun zijde, zal het een oger-groot inspanning vergen — en een heleboel hulp van Fiona en haar groep prinsessen — om Shrek en Artie de dag te laten redden en hun eigen "Lang en Gelukkig" te vinden.