Na het te gronde richten van een buitenaardse beschaving op Venus brengt het driehoofde, bliksem uitstralende ruimtemonster Ghidorah zijn onverzadigbare dorst naar vernietiging naar de Aarde, waar felle vijanden Godzilla, Rodan en Mothra de krachten moeten bundelen om de ongekende bedreiging het hoofd te bieden.