I London under andre verdenskrig trøster Wendy sine barn med historier om hennes ungdoms eventyr med Peter Pan i den fantastiske verden Neverland. Den unge Danny elsker historiene og tror de er sanne, men hans eldre søster, Jane, er ikke like sikker. Jane oppdager snart at moren hennes faktisk forteller sannheten når hun blir kidnapet av den onde Kaptein Krok og ført bort til deres hule i Neverland. Kroken prøver fortsatt å fange sin nemesis, Peter Pan, etter alle disse årene, og er sikker på at han vil komme til redning av sin gamle venn, Wendy; men Kroken innser for sent at han har tatt med seg Wendy's datter. Peter kommer til hjelp for den unge Jane, men mens de kjemper mot Kroken, innser han at det vil kreve litt arbeid før Jane passer inn blant Flere "Lost Boys".