Sequel do nagrodzonego Oscarem w 2009 roku spin-offu klasycznej serii s.f. z lat 60. Captain Kirk i załoga U.S.S. Enterprise zostają wezwani z powrotu na Ziemię po tym, jak wewnątrz ich organizacji wywołana została przerażająca siła, która doprowadziła do chaosu na planecie i osłabienia Starfleet. Zdecydowani na wyrównanie rachunków, Kirk wyrusza na pościg z resztą załogi, w tym Spockiem, Scottym i Chekovem, aby odnaleźć odpowiedzialną za to stronę, zanim ich cały świat zostanie zrównany z ziemią.