Po wyciągnięciu z morza z dwoma kulami w plecach, Jason Bourne budzi się na łodzi rybackiej bez wspomnień o swoim udziale w tajnym, czarnym projekcie CIA o nazwie Treadstone. Gdy zmagając się z utratą pamięci, jego byli pracodawcy nazywają go awanturnikiem i wyznaczają mu terminację. Bourne później ponownie odkrywa swoje niezwykłe umiejętności przetrwania, w tym walkę wręcz, sztuki walki i znajomość wielu języków, i zaczyna rozumieć, kim naprawdę jest.