Do deserto egípcio às profundezas abaixo das calotas polares, a elite equipe G.I. JOE usa o que há de mais recente em equipamentos de espionagem e militar de última geração para combater o corrupto fornecedor de armas Destro e a crescente ameaça da misteriosa organização Cobra, a fim de impedir que eles mergulhem o mundo no caos.