Miután a tengerből két golyóval a hátában húzták ki, Jason Bourne felébred egy halászhajón, memória nélkül arról, hogy része lett volna egy felső szintű, a CIA Treadstone nevű fekete műveleti részlegéhez tartozó, széfeltolásos programnak. Ahogy küzd a memóriája visszaszerzéséért, volt munkaadói földöntájékoztatják, hogy egy rogue ügynök, és célponttá teszik a likvidálásra. Bourne később újra felfedezi lenyűgöző túlélési képességeit, köztük a közelharcot, a harcművészeteket és a több nyelvet, és elkezdi megérteni, ki is ő valójában.