Na een oude wapenstilstand tussen de mensheid en het onzichtbare rijk van het fantastische die verbroken is, barst de hel op aarde uit. Een wrede leider die zowel de wereld boven als degene beneden bewandelt, tart zijn bloedlijn en wekt een onstuitbare leger van wezens op. Nu is het aan de hardste, stoerste superheld van de planeet om te vechten tegen de genadeloze dictator en diens rooftochten. Hij kan rood zijn. Hij kan gehoornd zijn. Hij kan verkeerd begrepen worden. Maar wanneer het werk goed gedaan moet worden, is het tijd om Hellboy in te schakelen. Samen met zijn uitdijende team in het Bureau for Paranormal Research and Development — pyrokineze vriendin Liz, aquatische empath Abe en protoplasmische mysticus Johann — zal the BPRD reizen tussen de oppervlaktelaag en de onzichtbare magische wereld, waar wezens van fantasie weer lichamelijk worden. En Hellboy, een schepsel van twee werelden die door beiden niet wordt geaccepteerd, moet kiezen tussen het leven dat hij kent en een onbekend noodlot dat hem roept.