Godzilla vs. King Ghidorah: Sett i 1992, science fiction-forfatteren Kenichiro Terasawa (Kosuke Toyohara) skriver en bok om Godzilla og får høre om en gruppe japanske soldater stasjonert på Lagos-øya under Gilbert- og Marshalløyene-kampanjen. I februar 1944, mens de trues av amerikanske soldater, blir de japanske soldatene reddet av en mystisk dinosaur. Han teorierer at dinosauren senere ble mutert til Godzilla i 1954 etter en hydrogenbombetest på øya. Yasuaki Shindo (Yoshio Tsuchiya), en velstående forretningsmann som kommanderte de japanske soldatene på Lagos-øya, bekrefter at dinosauren faktisk eksisterte. I mellomtiden lander et flygende teppe (UFO) på Mount Fuji. Når den japanske hæren undersøker, blir de møtt av Wilson (Chuck Wilson), Grenchiko (Richard Berger), Emmy Kano (Anna Nakagawa) og en androide, M-11 (Robert Scott Field). Besøkerne, kjent som «Futurians», forklarer at de er mennesker fra år 2204, hvor Godzilla har fullstendig ødelagt Japan. Futurianerne planlegger å reise tilbake i tid til 1944 for å fjerne dinosauren fra Lagos-øya før øya blir irradiert i 1954, og dermed forhindre mutasjonen av skapningen til Godzilla. Som bevis på sin historie viser Emmy en kopi av Terasawas bok, som ikke er fullført i nåtiden. Futurians, Terasawa, Miki Saegusa (Megumi Odaka) og professor Mazaki (Katsuhiko Sasaki) går om bord i en tidsfart og reiser tilbake til 1944 til Lagos-øya. Der, mens amerikanske styrker lander og kjemper mot de japanske styrkene ledet av Shindo, angriper dinosauren og dreper de amerikanske soldatene. Den amerikanske marinen sprenger deretter dinosauren fra sjøen og gir den alvorlige skader. Etter at Shindo og hans menn forlater øya, teleporterer M-11 dinosauren fra Lagos-øya til et sted i Beringstredet. Før de vender tilbake til 1992, legger Futurians i all hemmelighet igjen tre små skapninger kalt Dorats på Lagos-øya, som blir utsatt for stråling fra hydrogenbombetest i 1954 og smelter sammen til King Ghidorah, som deretter dukker opp i dagens Japan. Etter å ha kommet tilbake til 1992, bruker Futurians King Ghidorah for å undertrykke Japan. De gir ett ultimatum, men Japan nekter å overgi seg. Medfølende for det japanske folket avslører Emmy for Terasawa sannheten bak Futurians’ oppdrag: i fremtiden er Japan en økonomisk supermakt som har overgått USA, Russland og Kina. Futurians reiste tilbake i tid for å endre historien og forhindre Japans fremtidige økonomiske dominans ved å skape King Ghidorah og bruke den til å ødelegge dagens Japan. Samtidig planla de også å viske ut Godzilla fra historien slik at den ikke skulle true planene. Etter at M-11 tar Emmy tilbake til UFO-en, omprogrammerer hun androiden slik at den vil hjelpe henne. Med M-11 og Terasawas hjelp saboterer Emmy kontrollen UFO-en har over King Ghidorah. Samtidig planlegger Shindo å bruke sin kjernefysiske ubåt for å gjenskape Godzilla. På vei mot Beringstredet blir Shindos ubåt ødelagt av en allerede mutert Godzilla, som absorberer dens stråling og blir enda større og mer mektig. Terasawa oppdager at en russisk atomubåt sank i Beringstredet på 1970-tallet og slapp ut nok stråling til å mutere dinosauren til Godzilla. Godzilla ankommer Japan og møtes av King Ghidorah. De kjemper med lik styrke, hver immun mot den andres angrep. Godzilla avslutter til slutt kampen ved å sprenge Ghidorahs midtre hode. Før det endelige slaget, ødelegger Godzilla UFO-en og dreper Wilson og Grenchiko. Godzilla retter deretter oppmerksomheten mot Tokyo, ødelegger metropolen og dreper Shindo. Emmy reiser til fremtiden med M-11 og vender tilbake til nåtiden med Mecha-King Ghidorah, en cybernetisk versjon av King Ghidorah. Den cybernetiske Ghidorah sprenger Godzilla med energistråler, noe som viser seg å være nytteløst. Godzilla svarer deretter ved å relentless sprenge Ghidorah med sitt atomiske stråle, og nesten hjerner Ghidorah. Ghidorah overlever, men deretter seirer Godzilla, og slår Ghidorah ned. Emmy bærer bort Godzilla og slipper den og Ghidorah i havet. Emmy vender deretter tilbake til fremtiden, men ikke før hun informerer Terasawa om at hun er hans avkom. På bunnen av havet våkner Godzilla og brøler over Ghidorahs ruiner før han svømmer av gårde. Godzilla og Mothra: Slaget om Jorden Sett i midten av 1992, etter hendelsene i forrige film (Godzilla vs. King Ghidorah), lander en meteoroide i Ogasawara-gravaen og vekker Godzilla. Seks måneder senere blir oppdageren Takuya Fujito holdt tilbake etter å ha stjålet en gammel artefakt. Senere tilbyr en representant for den japanske statsministeren å få straffepåleggene frafalt dersom han utforsker Infant Island sammen med sin ekskone, Masako Tezuka, og Kenji Ando, sekretæren for det grådig Marutomo-selskapet. Når trioen ankommer øya, finner de en hule som inneholder en fremstilling av to gigantiske insekter i kamp. Videre utforskning fører dem til et gigantisk egg og et par små humanoide vesener kalt Cosmos, som identifiserer egget som tilhører Mothra. Cosmos forteller om en gammel sivilisasjon som prøvde å kontrollere jordens klima, noe som førte til at jorden ble provosert til å skape Battra, som ble ukontrollerbar, og begynte å skade selve planeten den skapte. Mothra, en annen jordverner, kjempet en apokalyptisk kamp med Battra, som til slutt tapte. Cosmosene forklarer hvordan meteoroiden avdekket Mothras egg, og kan ha vekket Battra, som fortsatt er bitter over menneskehetens innblanding i jordens naturlige orden. Marutomo-selskapet sender et fraktefartøy til Infant Island for å hente egget, tilsynelatende for å beskytte det. Mens de seiler, overflates Godzilla og beveger seg mot den nyklekte Mothra-larven. Battra, også som en larve, dukker snart opp og blir med i kampen, noe som lar Mothra trekke seg tilbake. Slaget mellom Godzilla og Battra blir til slutt tatt under vann, hvor slagets kraft forårsaker en gigantisk sprekk i havbunnen som svelger de to. Masako og Takuya oppdager senere Andos sanne intensjoner når han kidnapper Cosmos og tar dem til Marutomo-hovedkvarteret, hvor administrerende direktør har til hensikt å bruke dem til PR-formål. Mothra går inn i Tokyo i et forsøk på å redde Cosmos, men blir angrepet av JSDF. Den sårede Mothra retter seg mot Diet-byggingen og begynner å bygge en kokong rundt seg selv. I mellomtiden kommer Godzilla opp av Mount Fuji. Både Mothra og Battra oppnår sine imago-former og møtes ved Yokohama Cosmo World. Godzilla avbryter kampen og angriper Battra. De to møllene bestemmer seg for å slå seg sammen mot Godzilla. Til slutt overmanner Mothra og Battra Godzilla og fører den over havet. Godzilla biter Battras nakke og skyter sitt atomstråle inn i såret, som dreper Battra. En sliten Mothra dropper Godzilla og den livløse Battra i vannet nedenfor, og forsegler Godzilla under overflaten ved å skape en mystisk tegn med skjellene fra vingene. Neste morgen forklarer Cosmos at Battra hadde ventet mange år på å ødelegge et enda større meteoroid som ville true jorden i 1999. Mothra hadde lovet å stoppe fremtidig kollisjon hvis Battra døde, og hun og Cosmos forlater Jorden mens menneskene tar farvel.